The Dangers in My Heart, film diretto da Hiroaki Akagi, racconta la storia di Kyotaro Ichikawa, uno studente delle scuole medie apparentemente ordinario, ma dentro di sé nasconde pensieri oscuri e un profondo senso di inadeguatezza. La sua attenzione è spesso catturata da Anna Yamada, una delle ragazze più belle, popolari e solari della scuola. Tuttavia, quando Ichikawa inizia a conoscerla davvero, la sua percezione cambia radicalmente. Il comportamento spontaneo e imprevedibile di Yamada, come abbuffarsi di snack in biblioteca, canticchiare distrattamente o avvicinarsi a lui senza preavviso, mette in crisi Ichikawa, che finisce per pensare a lei sempre più spesso. Senza rendersene conto, Yamada diventa il centro dei suoi pensieri quotidiani.
Col passare del tempo e grazie ai momenti trascorsi insieme, anche Anna Yamada comincia a provare un'attrazione sincera per Ichikawa, scoprendo emozioni nuove e inaspettate. Per entrambi è la prima vera esperienza nel comprendere cosa significhi piacere a qualcuno e sentirsi accettati.
Tra incomprensioni, situazioni imbarazzanti ed emozioni autentiche, la distanza emotiva tra i due si riduce, dando vita a una storia di crescita personale e sentimentale.
Nel frattempo Kana Ichikawa, sorella maggiore di Kyotaro, decide di utilizzare gli appunti del diario del fratello come ispirazione per scrivere una canzone. Per evitare che i suoi pensieri più intimi vengano resi pubblici, Ichikawa si ritrova costretto a collaborare con le Primary COLOR, il gruppo musicale di sua sorella. Il risultato sarà una canzone che si trasforma in una dichiarazione d'amore per Yamada.